「Edit site preferences」の使い方がようやく分かった。

遅すぎるというツッコミは却下。
以下、私なりの使い方。
１、まずＦ１２を押して、「Quick preferences」を出す。
２、「Enable 〜」をすべてオフに。
３、そのまま普通にブラウズ。
４、CookieやJavaScriptなどをオンにしてくださいという警告を受け、それらの機能が必要になる。
５、ここで、「Quick preferences」を出さず、右クリックで「Edit site preferences」を出す。
６、Cookieなら、「Cookies」のタブで「Accept Cookies」に変更する。JavaScriptなら、「Scripting」のタブで「Enable JavaScript」にチェック。Flashなら「Content」のタブの（以下略）
７、ページをリロードしてそれぞれの機能が動作するかチェック。
こうすれば、許可したサイト以外で要らない機能が動作することは無いと思われ。
「Tools」→「Advanced」→「Cookies」で設定の変更も出来る。
って、ここまで神経質にならずにＦ１２で切り替えるだけでも十分事足りるのかもしれない。